ну, ситуация такая: если вы транскодируете ффмпегом, то тут мы мало чем поможем.
С транскодером в флюссонике _можно_ добиться практически бесшовного переключения.
Что ещё важно понимать: вы берете данные не по SDI (наверное), так что всегда существует проблема детекции потери сигнала.
в интернете невозможно отличить обрыв связи от достаточного долгого таймаута, поэтому «потеря источника» — это всегда срабатывание таймаута.
Чем меньше таймаут, тем быстрее сработает, но с какого-то момента это будет просто нерабочим вариантом, потому что начнет дрыгаться при том качестве сигнала, который человек воспринимает как приемлемый.