Короче, пацаны, я немного починил, дело было в дикомах или в pydicom. Не суть, просто как только заменил дикомы на жпеги, то на эпохуй теперь тратится 30 мин, но при этом утилизация гпу по прежнему 0
У дикомов, как правило, очень высокое разрешение. Не знаю важно ли это в твоём случае, но DICOM -> JPEG will be a highly lossy compression