ну так если в солюшене есть десктоп и апи, десктоп ссылается на апи. Если я запущу десктоп апи же само собой не запуститься и соответственно работать не будет?
Точно тебе не скажу, не сталкивался, но где-то можно повесить это говно, чтобы оно запускалось вместе с десктопным софтом. У меня в проекте, которому лет 150, всё в батниках и вся автоматизация существует только на билд сервер, всё остальное ручками)