Так вот.
Подсказки к вопросам. Транспортный уровень отвечает за передачу данных. Он выше сетевого уровня, где решаются проблемы маршрутизации, коммутации и трансляции логических адресов в физические. И ниже сеансового, представительского и прикладного уровней, которые если смотреть снизу — занимаются собственно бизнес-логикой процесса.
То есть, rsync over nfs это таки транспорт. И FTP с HTTP — тоже транспорты, коль сколько мы говорим о доставке изменений.
Выше этого может быть прикладной уровень в виде rpm, dpkg или более высокоуровневых средств автоматизации деплоймента и перезапуска сервисов.