Примеров бесконечное количество. Но вот один, который пришел на ум - данные медицинских исследований оказались скомпрометированы потому что скрипт на питоне, который их анализировал, опирался на порядок файлов с источниками данных. И то ли там потом на вход подали файлы с большими буквами в именах, то ли что-то в этом духе. И то, что работало под виндой, под никсами отработало неправильно. И много лет на базе результатов этого скрипта лечили людей