нельзя просто взять и поставить докер, если у тебя openvz контейнер ) level=fatal msg="Your Linux kernel version 2.6.32-042stab133.2 is not supported for running docker. Please upgrade your kernel to 3.10.0 or newer."
На днях сдался и не стал писать "своё R-Tree", а взял libspatialindex (проблемы возникли только с тем, как собрать это на целевую платформу, и то нашёл собранное)