Ну ок, тогда просто Создаём 2 приложения, первое слушает wndproc и при получении спец. сообщения выводим текст в консоль, а другое приложение будет слать сообщения через SendMessage
Ну или на крайний случай у двух приложений юзаем filesystemwatcher, и в файле пишем команды, а другая прога когда детектит изменение, читает и выполняет команду