Есть два варианта:
Первый это смотреть журнал сколько времени уходит на 1ю и 2ю фазу, и рассчитать с условием что в момент окончания 3й фазы, 1я фаза нового плота близилась к завершению (как пример у меня 2 нвме по 1тб. Я запускаю по 3 потока с диска, задержка 70 минут. Через 7 часов я запускаю ещё по 3 потока с диска. Всё норм, в память не упирается. Но делаю я это все через программу чиа, не через батник)