по сравнению с оверхедом связанным с рукожопством программистов в большинстве случаев этим оверхедом можно пренебречь :)
у меня то вопрос возник, потому что пока ни разу нигде не встречал мануалы, да и не слышал, чтобы инфраструктуру внутреннюю поднимали на базе контейнеров, хотя по мне это очень даже удобнее должно быть. Все зависимости в одном контейнере, данные хранятся в определенном месте в системе.