Сергей Марков1 июня 2021 года в исследовательском блоге компании Google появилось
сообщение о том, что её исследователи, совместно с коллегами из Лаборатории Лихтмана [Lichtman Laboratory] в Гарвардском университете, опубликовали датасет под названием «H01». Этот набор данных объёмом 1,4 петабайта содержит информацию о небольшом фрагменте коры головного мозга человека. Ряд технических подробностей можно узнать из сопроводительной статьи под названием «Коннектомное исследование петамасштабного фрагмента коры мозга человека» [
A connectomic study of a petascale fragment of human cerebral cortex], вышедшей днём ранее на сайте препринтов bioRxiv.
Фрагмент ткани объёмом около кубического миллиметра, положенной в основу исследования, был извлечён в ходе хирургической операции из височной доли коры головного мозга 45-летней пациентки, страдающей от устойчивой к медикаментам эпилепсии. При помощи микротома этот фрагмент был разделён более чем на 5000 срезов толщиной 30 нм, а затем отсканирован при помощи высокоскоростного многолучевого сканирующего электронного микроскопа с пространственным разрешением 4 × 4 нм. Данные, полученные в результате сканирования, были затем превращены в трёхмерную модель при помощи уже знакомых нам по более ранним работам закрашивающих сетей (Flood-Filling Networks, FFNs) и вспомогательных вычислительных моделей. В результате был получен набор данных, содержащий детальные сведения о 50 000 клеток, сотнях миллионов их отростков (авторы статьи употребляют термин нейриты — собирательное понятие для аксонов и дендритов) и примерно 130 миллионах синапсов. На сегодняшний день «H01» является крупнейшим детально аннотированным набором данных, описывающим образец мозговой ткани.
Ознакомиться с данными можно в обычном браузере при помощи специального интерфейса, получившего название
Neuroglancer (дословно «нейронаблюдатель»).