Чтобы не применять модификаторы нужно просто переместить материал в стэке материалов выше и вуаля. Сорян за телефон на работе интернет залочен
вообще-то булеан оставляет фейсы со слотом материала, каким вырезает. Т.е нужно чтобы вырезал 4й материал по счету - в объекте, которым вырезаешь создаешь 4 слота и ставишь последний