Лучше настраивать аппарат «как новый», а важные данные «подтянутся» из облака, когда введёшь Apple ID.
Если не устраивает данный метод из-за долгой установки и настройки приложений, то бэкап в облаке. На практике меньше риск переноса багов из бэкапа.
Тунцом советую пользоваться в крайних случаях (когда собираешься ставить бету iOS, делать джейлбрейк или же даунгредиться)
Кстати забыл спросить , какие ВАЖНЫЕ данные подтянуться ?