ну я могу попробовать вангануть что один это есть энгулар компилятор а второй это его нейкая обертка для cli + весь остальной пайплайн компйлинг процесса в ключая ts и тп, но лучше наверно глянуть исходники
Нашел что @angular/compiler-cli состоит из ngtsc, который ищет декораторы и превращает их в JS инструкции и ngcc, который все под айви подшаманивает. Но что-то не пойму что тогда основной делает