Тут у тебя как раз влияет порядок выполнения, потому что при получении апдейта ботом запускается таск, в котором он обрабатывается и без ожидания завершения обработки производится получение следующих апдейтов.

При использовании полинга есть способ частично уйти от такого поведения, (параметр fast=False), так при получении пачки апдейтов они будут обрабатыватся поочередно (сохраняя порядок), но с одним ньюансом - следующая "пачка" апдейтов обрабатыватся будет как и ранее в отдельном таске без ожидания завершения предыдущей. Такое поведение помогает адекватно обрабатывать группы сообщений (форварды/альбомы/быстро отправленная группа сообщений)