Строительство космодрома началось в 2012 году и сопровождалось коррупционными скандалами, а также забастовками рабочих из-за задержек зарплаты. Решить эти проблемы было поручено заместителю председателя правительства РФ Дмитрию Рогозину, который в сентябре 2014 года был назначен координатором стройки. За время строительства космодрома Рогозин более 50 раз посещал стройку с рабочими визитами.
В апреле 2015 года общая задолженность по заработной плате составляла более 150 млн рублей. Проблема стояла настолько остро, что строители устраивали голодовку в знак протеста, а вопрос о невыплате зарплат был поднят на «Прямой линии с Владимиром Путиным»[50].
В ноябре 2018 года официальный представитель Генпрокуратуры России Александр Куренной сообщил, что по фактам нарушений при строительстве космодрома возбуждено свыше 140 уголовных дел, а ущерб составил более 10 млрд рублей[51].