Это не подсчет времени а вычисление интеграла мгновенного тока (причем обоих полярностей) по времени. Этим занимается любой более менее приличный контроллер лития.
Причина не важна, на самом деле, но можно хоть как-то объяснить требования, прописанные в инструкции. А с обычными аккумуляторами и требований нет, но есть поверья.