и вот это странно
join_collapse_limit = 1

на настройку привлекали стороннего человека.
посомтрел - действительно непонятно зачем дублировать параметры.

они не дублируются, они разные

ага :( и какие отрабатываются?

join_collapse_limit (integer)
Задаёт максимальное количество элементов в списке FROM, до достижения которого планировщик будет сносить в него явные конструкции JOIN (за исключением FULL JOIN). При меньших значениях сокращается время планирования, но план запроса может стать менее эффективным.

По умолчанию эта переменная имеет то же значение, что и from_collapse_limit, и это приемлемо в большинстве случаев. При значении, равном 1, предложения JOIN переставляться не будут, так что явно заданный в запросе порядок соединений определит фактический порядок, в котором будут соединяться отношения. Так как планировщик не всегда выбирает оптимальный порядок соединений, опытные пользователи могут временно задать для этой переменной значение 1, а затем явно определить желаемый порядок.

насколько я знаю последние

online_analyze.threshold = 50
online_analyze.scale_factor = 0.1
online_analyze.enable = off
online_analyze.verbose = off
online_analyze.local_tracking = on
online_analyze.min_interval = 10000
online_analyze.table_type = 'temporary'

и далее

online_analyze.threshold = 50
online_analyze.scale_factor = 0.01
online_analyze.enable = on
online_analyze.verbose = off
online_analyze.local_tracking = on
online_analyze.min_interval = 10000.
online_analyze.table_type = 'temporary'

Рекомендации 1с
temp_buffers = 256MB (у вас 32)
Максимальное количество страниц для временных таблиц. Т.е. это верхний лимит размера временных таблиц в каждой сессии.
мне кажется вот это важно

Нормальный сервак, на ssd ubuntu и базы, raid для backup

воентелеком?

да нет, просто кто-то распродаёт старое железо. И вот нашёлся "доверчивый" покупатель

300Гб - их ещё найти нужно в наше время

У кого базы по 300гб?

Вы чё фильмы храните в таблицах

И не говори... Кто эти карлики??? )))))))

Реально

Я понимаю там хабрахабр

Там дохоена статей, база может гигов на 200

200 это нормально.
У меня есть база с одной таблицей 800 гиг