То есть скорее всего, все же, баг в марлине?
Скорее всего я не знаю что это :) Я про версию с системой координат - эту версию легко проверить по файлам на карте памяти. А то может действительно, в конце печати переходит в относительную, а на старте ее включает абсолютную