Скорее всего в проводах и разъемах где-то. Для теста, сделайте провод напрямую от платы до двигателя. И еще вариант - подключите ось Z в разъем другой оси, с которой проблем нет и попробуйте подвигать.
Ось Z как раз и идет одним шлейфом из материнки к двигателю, т.е. не через коммутационную плату.
Я там в сообщении указал - переткнул разъемы от Y и Z моторов на плате - проблема перешла на Y ось, т.е. выглядит как проблема до драйвера или в самом разъеме мотора на плате, но вряд ли он сам отвалился