В FCP7 это есть и называется Media Management - экспорт только того, что вошло в монтаж с обрезанием без захлестов. Это умеют все программы монтажа. Если X этого не умеет, то программа странная тогда.
Уважаемый, Михайло. У меня нет решения вашей проблемы. Я написал, чтоб показать, что понимаю вас и, что это возможно в 7 и во ВСЕХ современных монтажках. И, чтобы привлечь внимание к вашей проблеме. Возможно, напрасно. Успеха.