Например, есть программа/функция (в нативном коде), а есть инструкция/команда. При этом инструкцией обычно называют как отдельный тип инструкции (mov, add, call, cmpxchg16b), так и элемент, из которых состоит программа.
Я согласен на такое же обозначение (в смысле, что одинаково будет называться и тип и элемент, хотя в идеале лучше по-разному, чтобы не путаться), только хочется вместо "инструкция байткода" найти более удобоваримое обозначение. "Элемент байткода" — тоже не ложиться как-то.