Для дома, FDE это идеальный вариант как по мне. Всякие шифрование хомяка, ёжика и прочих кусочков системы, это полумеры, грабли которых будут постоянно вылезать, а вот я мимо хомяка что-то сохранил, а вот у меня конфиг там а в нем пароль, а вот вот вот ... Что бы не болела голова об этом есть FDH, в идеале с ним можно еще использовать LVM2. Что бы была абстракция над дисками. Можно будет мигрировать систему на другой диск не перезагружая ее.