А, пфф. Прикол то в том, что в линуксах нету нормального буффера обмена. Зато ести три пародии, при чём все три теряют данные при закрытии приложения из которого ты копировал. Так что это, как ни странно, нормальное поведение
А теряют потому что в иксах клипборд - это операция между клиентами, один клиент запрашивает содержимое напрямую у другого, X-сервер его нигде не хранит