Что "неверно"? Python-библиотеки, которые есть в репах арча и нужны глобально в системе, нужно ставить через pacman. Если что-то для личных нужд (например, какой-то проект) — виртуальное окружение, которое не наследует и не влияет на глоальные пакеты
Собственно, что и получилось. Удали тот пакет через pip и установи его через pacman