АК
выяснилось, что кодировка одного из файлов не UTF-8
т.е. лайфхак такой: все файлы в UTF, при чтении их в R кодировку не указывать
в итоге - на windows кракозябры и ничего не работает, но на shinyapp.io все норм
uchardet::detect_file_enc
можно пробежаться.